Dalam rangka memberikan kesempatan bagi peserta didik MAN Berau untuk mengembangkan minat dan hobi selama menjadi siswa MAN Berau, maka diadakanlah kegiatan pengembangan diri yakni Ekstrakurikuler.
Ekstrakurikuler atau ekskul ini adalah salah satu kegiatan atau aktivitas tambahan yang dilakukan di luar jam pelajaran yang dilakukan baik di sekolah atau di luar sekolah itu dengan tujuan untuk bisa mendapatkan tambahan pengetahuan, keterampilan serta wawasan dan juga membantu di dalam membentuk karakter peserta didik itu sesuai dengan minat serta bakat tiap-tiap individu.
Menurut Surat Keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan No. 060/U/1993 dan Nomor 080/U/1993, Kegiatan atau aktivitas ekstrakurikuler merupakan kegiatan atau aktivitas yang diselenggarakan di luar jam pelajaran yang tercantum di dalam susunan program sesuai dengan keadaan serta kebutuhan sekolah, serta dirancang dengan secara khusus supaya sesuai dengan faktor minat serta bakat siswa.
Merujuk pada Peraturan Menteri Pendidikan Nasional RI No.39 Tahun 2008 tentang Pembinaan Kesiswaan, bahwa Kegiatan ekstrakurikuler ini merupakan salah satu jalur pembinaan kesiswaan. Kegiatan atau aktivitas ekstrakurikuler yang diikuti serta dilaksanakan oleh siswa baik di sekolah atau pun di luar sekolah, itu memiliki tujuan supaya siswa dapat atau bisa memperkaya serta memperluas diri.
Berikut Kegiatan Ekstrakurikuler di MAN Berau :
1. BASKETBALL
2. ENGLISH CLUB
3. FUTSAL
4. HADRAH
5. KALIGRAFI
6. MUSIK AKUSTIK
7. OLIMPIADE ASTRONOMI
8. OLIMPIADE BIOLOGI
9. OLIMPIADE FISIKA
10. OLIMPIADE GEOGRAFI
11. OLIMPIADE KIMIA
12. OLIMPIADE MATEMATIKA
13. OLIMPIADE TIK
14. OSIS
15. PANAHAN
16. PASKIBRA/LKBB
17. PIK REMAJA
18. PMR
19. PRAMUKA
20. ROHIS
21. SENI TARI
22. VOLLY BALL